他社の意匠権を侵害するデザインの建物には、建築中であれば差止請求、建築後であれば損害賠償請求のリスクが発生します。
　また、引き渡した建物が商業建築物であれば、建築物を業務使用していることになりますので、上記に加えて取り壊し請求も可能です。
　もし意匠権を侵害していることが判明した場合には、意匠登録権利者から実施許諾を得る交渉をしていくことが現実的かと思います。